微生物进化系统的多项分类(polyphasic taxonomy)包括了表观分类、化学分类及分子分类各个分类水平的分析。简单归纳如下:
表观信息
(1) 表观特征:形态、培养特征及生理生化特性等、酶学、血清学(单克隆、多克隆)。
(2) 化学分类特征:细胞脂肪酸、枝菌酸、磷脂类脂、酶类、醌类、多胺、细胞壁化学组分、多糖。
(3) 电泳谱分析:蛋白质氨基酸分析(一维、二维结构);酶型分析。
基因型信息
(1) DNA总体:(G+C)含量、限制性酶切反应(RFLP,PFGE)、基因组大小、DNA-DNA杂交。
(2) DNA片段:核酸分型(PCR扩增后分析ARDRA、RAPD、AFLP)、DNA探针、DNA测序分析。
(3) RNA:碱基序列分析、小分子RNA分型。
(4) RFLP即限制性内切酶片段长度多态性;PFGE即脉冲场凝胶电泳。
(5) ARDRA即rDNA扩增片段限制性内切酶分析;RAPD即随机扩增多态性DNA。
(6) AFLP即扩增片段长度多态性。
《放线菌快速鉴定与系统分类》 阮继生 黄英 编著